通常情况下，根文件系统所占空间一般应该比较小，因为其中的绝大部分文件都不需要经常改动，而且包括严格的文件和一个小的不经常改变的文件系统不容易损坏。
根目录一般不含任何文件，所有其他文件在根文件系统的子目录中。
1. /bin目录
/bin目录包含了引导启动所需的命令或普通用户可能用的命令(可能在引导启动后)。这些命令都是二进制文件的可执行程序( bin是binary 二进制的简称)，多是系统中重要的系统文件。
2. /sbin目录
/sbin目录类似/bin ，也用于存储二进制文件。因为其中的大部分文件多是系统管理员使用的基本的系统程序，所以虽然普通用户必要且允许时可以使用，但一般不给普通用户使用。
3. /etc目录
/etc目录存放着各种系统配置文件，其中包括了用户信息文件/etc/passwd，系统初始化文件/etc/rc等。linux正是*这些文件才得以正常地运行。
4. /root目录
/root 目录是超级管理员用户的目录。
5. /lib目录
/lib目录是根文件系统上的程序所需的共享库，存放了根文件系统程序运行所需的共享文件。这些文件包含了可被许多程序共享的代码，以避免每个程序都包含有相同的子程序的副本，故可以使得可执行文件变得更小，节省空间。又叫动态链接共享库，作用类似windows里的.dll文件。
6. /lib/modules 目录
/lib/modules 目录包含系统核心可加载各种模块，尤其是那些在恢复损坏的系统时重新引导系统所需的模块(例如网络和文件系统驱动)。
7. /dev目录
/dev目录存放了设备文件，即设备驱动程序，用户通过这些文件访问外部设备。比如，用户可以通过访问/dev/mouse来访问鼠标的输入，就像访问其他文件一样。
8. /dev目录
/dev目录存放了设备文件，即设备驱动程序，用户通过这些文件访问外部设备。比如，用户可以通过访问/dev/mouse来访问鼠标的输入，就像访问其他文件一样。
9. /mnt目录
/mnt目录是系统管理员临时安装( mount )文件系统的安装点。程序并不自动支持安装到/mnt 。/mnt 下面可以分为许多子目录，例如/mnt/dosa 可能是使用msdos文件系统的软驱，而/mnt/exta 可能是使用ext2文件系统的软驱，/mnt/cdrom 光驱等等。
10./home目录
用户主目录的基点，比如用户user的主目录就是/home/user，可以用~user表示。
11./var目录
/var 某些大文件的溢出区，比方说各种服务的数据和日志文件。
12./lost+found目录
这个目录平时是空的，系统非正常关机而留下“无家可归”的文件（windows下叫什么.chk）就在这里。
13./proc目录
虚拟的目录，是系统内存的映射。可直接访问这个目录来获取系统信息。
14. /tmp目录
/tmp 目录存放程序在运行时产生的信息和数据。但在引导启动后，运行的程序最好使用/var/tmp来代替/tmp ，因为前者可能拥有一个更大的磁盘空间。
15./usr目录
/usr 最庞大的目录，要用到的应用程序和文件几乎都在这个目录，其中包含：
/usr/x11R6 存放x window的目录
/usr/bin 众多的应用程序
/usr/sbin 超级用户的一些管理程序
/usr/doc linux文档
/usr/include linux下开发和编译应用程序所需要的头文件
/usr/lib 常用的动态链接库和软件包的配置文件
/usr/man 帮助文档
/usr/src 源代码，linux内核的源代码就放在/usr/src/linux里
/usr/local/bin 本地增加的命令
/usr/local/lib 本地增加的库
二、几个主要目录的子目录结构：
/etc文件系统
/etc 目录包含各种系统配置文件，下面说明其中的一些。其他的你应该知道它们属于哪个程序，并阅读该程序的man页。许多网络配置文件也在/etc 中。
1. /etc/rc或/etc/rc.d或/etc/rc?.d
启动、或改变运行级时运行的脚本或脚本的目录。
2. /etc/passwd
用户数据库，其中的域给出了用户名、真实姓名、用户起始目录、加密口令和用户的其他信息。
3. /etc/fdprm
软盘参数表，用以说明不同的软盘格式。可用setfdprm 进行设置。更多的信息见setfdprm
的帮助页。
4. /etc/fstab
指定启动时需要自动安装的文件系统列表。也包括用swapon -a启用的swap区的信息。
5. /etc/group
类似/etc/passwd ，但说明的不是用户信息而是组的信息。包括组的各种数据。
6. /etc/inittab
init 的配置文件。
7. /etc/issue
包括用户在登录提示符前的输出信息。通常包括系统的一段短说明或欢迎信息。具体内容由系统管理员确定。
8. /etc/magic
“file”的配置文件。包含不同文件格式的说明，“file”基于它猜测文件类型。
9. /etc/motd
m o t d是message of the day的缩写，用户成功登录后自动输出。内容由系统管理员确定。常用于通告信息，如计划关机时间的警告等。
10. /etc/mtab
当前安装的文件系统列表。由脚本( scritp )初始化，并由mount 命令自动更新。当需要一个当前安装的文件系统的列表时使用(例如df 命令)。
11. /etc/shadow
在安装了影子( shadow )口令软件的系统上的影子口令文件。影子口令文件将/etc/passwd文件中的加密口令移动到/etc/shadow中，而后者只对超级用户root可读。这使破译口令更困难，以此增加系统的安全性。
12. /etc/login.defs
login命令的配置文件。
13. /etc/printcap
类似/etc/termcap ，但针对打印机。语法不同。
14. /etc/profile 、/etc/csh.login、/etc/csh.cshrc
登录或启动时bourne或c shells执行的文件。这允许系统管理员为所有用户建立全局缺省环境。
15. /etc/securetty
确认安全终端，即哪个终端允许超级用户(root)登录。一般只列出虚拟控制台，这样就不可能(至少很困难)通过调制解调器(modem)或网络闯入系统并得到超级用户特权。
16. /etc/shells
列出可以使用的shell。chsh 命令允许用户在本文件指定范围内改变登录的shell。提供一台机器ftp服务的服务进程ftpd 检查用户shell是否列在/etc/shells 文件中，如果不是，将不允许该用户登录。
17. /etc/termcap
终端性能数据库。说明不同的终端用什么“转义序列”控制。写程序时不直接输出转义序列(这样只能工作于特定品牌的终端)，而是从/etc/termcap 中查找要做的工作的正确序列。这样，多数的程序可以在多数终端上运行。
/proc文件系统
/proc 文件系统是一个伪的文件系统，就是说它是一个实际上不存在的目录，因而这是一个非常特殊的目录。它并不存在于某个磁盘上，而是由核心在内存中产生。这个目录用于提供关于系统的信息。下面说明一些最重要的文件和目录(/proc 文件系统在proc man页中有更详细的说明)。
1. /proc/x
关于进程x的信息目录，这一x是这一进程的标识号。每个进程在/proc 下有一个名为自己进程号的目录。
2. /proc/cpuinfo
存放处理器(cpu)的信息，如cpu的类型、制造商、型号和性能等。
3. /proc/devices
当前运行的核心配置的设备驱动的列表。
4. /proc/dma
显示当前使用的dma通道。
5. /proc/filesystems
核心配置的文件系统信息。
6. /proc/interrupts
显示被占用的中断信息和占用者的信息，以及被占用的数量。
7. /proc/ioports
当前使用的i/o端口。
8. /proc/kcore
系统物理内存映像。与物理内存大小完全一样，然而实际上没有占用这么多内存；它仅仅是在程序访问它时才被创建。(注意：除非你把它拷贝到什么地方，否则/proc 下没有任何东西占用任何磁盘空间。)
9. /proc/kmsg
核心输出的消息。也会被送到syslog。
10. /proc/ksyms
核心符号表。
11. /proc/loadavg
系统“平均负载”； 3个没有意义的指示器指出系统当前的工作量。
12. /proc/meminfo
各种存储器使用信息，包括物理内存和交换分区(swap)。
13. /proc/modules
存放当前加载了哪些核心模块信息。
14. /proc/net
网络协议状态信息。
15. /proc/self
存放到查看/proc 的程序的进程目录的符号连接。当2个进程查看/proc 时，这将会是不同的连接。这主要便于程序得到它自己的进程目录。
16. /proc/stat
系统的不同状态，例如，系统启动后页面发生错误的次数。
17. /proc/uptime
系统启动的时间长度。
18. /proc/version
核心版本
/dev文件系统
/dev 目录包括所有设备的设备文件。设备文件用特定的约定命名，这在设备列表中说明。
设备文件在安装时由系统产生，以后可以用/dev/makedev 描述。/dev/makedev.local是系统管理员为本地设备文件(或连接)写的描述文稿(即如一些非标准设备驱动不是标准makedev 的一部分)。下面简要介绍/dev下一些常用文件。
1. /dev/console
系统控制台，也就是直接和系统连接的监视器。
2. /dev/hd
ide硬盘驱动程序接口。如： /dev/hda指的是第一个硬盘， had1则是指/dev/hda的第一个分区。如系统中有其他的硬盘，则依次为/dev/hdb、/dev/hdc、. . . . .；如有多个分区则依次为hda1、hda2 . . . . . .
3. /dev/sd
scsi磁盘驱动程序接口。如有系统有scsi硬盘，就不会访问/dev/had，而会访问/dev/sda。
4. /dev/fd
软驱设备驱动程序。如： /dev/fd0指系统的第一个软盘，也就是通常所说的a：盘，/dev/fd1指第二个软盘，. . . . . .而/dev/fd1 h1440则表示访问驱动器1中的4 . 5高密盘。
5. /dev/st
scsi磁带驱动器驱动程序。
6. /dev/tty
提供虚拟控制台支持。如： /dev/tty1指的是系统的第一个虚拟控制台， /dev/tty2则是系统的第二个虚拟控制台。
7. /dev/pty
提供远程登陆伪终端支持。在进行telnet登录时就要用到/dev/pty设备。
8. /dev/ttys
计算机串行接口，对于dos来说就是“com1”口。
9. /dev/cua
计算机串行接口，与调制解调器一起使用的设备。
10. /dev/null
“黑洞”，所有写入该设备的信息都将消失。例如：当想要将屏幕上的输出信息隐藏起来时，只要将输出信息输入到/dev/null中即可。
/usr文件系统
/usr 是个很重要的目录，通常这一文件系统很大，因为所有程序安装在这里。/usr 里的所有文件一般来自linux发行版(distribution)；本地安装的程序和其他东西在/usr/local 下，因为这样可以在升级新版系统或新发行版时无须重新安装全部程序。/usr目录下的许多内容是可选的，但这些功能会使用户使用系统更加有效。/usr可容纳许多大型的软件包和它们的配置文件。下面列出一些重要的目录。
1. /usr/x11r6
包含x window系统的所有可执行程序、配置文件和支持文件。为简化x的开发和安装，x的文件没有集成到系统中。x window系统是一个功能强大的图形环境，提供了大量的图形工具程序。
2. /usr/local
本地安装的软件和其他文件放在这里。这与/usr很相似。用户可能会在这发现一些比较大的软件包，如tex、emacs等。
3. /usr/bin
集中了几乎所有用户命令，是系统的软件库。另有些命令在/bin 或/usr/local/bin 中。
4. /usr/sbin
包括了根文件系统不必要的系统管理命令，例如多数服务程序。
5. /usr/man、/usr/info、/usr/doc
这些目录包含所有手册页、g n u信息文档和各种其他文档文件。每个联机手册的“节”都有两个子目录。例如： /usr/man/man1中包含联机手册第一节的源码(没有格式化的原始文件)，/usr/man/cat1包含第一节已格式化的内容。1联机手册分为以下九节：内部命令、系统调用、库函数、设备、文件格式、游戏、宏软件包、系统管理和核心程序。
6. /usr/include
包含了c语言的头文件，这些文件多以. h结尾，用来描述c语言程序中用到的数据结构、子过程和常量。为了保持一致性，这实际上应该放在/usr/lib 下，但习惯上一直沿用了这个名字。
7. /usr/lib
包含了程序或子系统的不变的数据文件，包括一些site-wide配置文件。名字lib来源于库(library); 编程的原始库也存在/usr/lib 里。当编译程序时，程序便会和其中的库进行连接。也有许多程序把配置文件存入其中。
/var文件系统
/var 包含系统一般运行时要改变的数据。通常这些数据所在的目录的大小是要经常变化或扩充的。原来/var目录中有些内容是在/usr中的，但为了保持/usr目录的相对稳定，就把那些需要经常改变的目录放到/var中了。每个系统是特定的，即不通过网络与其他计算机共享。下面列出一些重要的目录(一些不太重要的目录省略了)。
1. /var/lib
存放系统正常运行时要改变的文件。如很多发行版的默认安装mysql数据库目录在/var/lib/mysql。
2. /var/local
存放/usr/local 中安装的程序的可变数据(即系统管理员安装的程序)。注意，如果必要，即使本地安装的程序也会使用其他/var 目录，例如/var/lock 。
3. /var/log
各种程序的日志(log)文件，尤其是login (/var/log/wtmp 纪录所有到系统的登录和注销) 和syslog (/var/log/messages 纪录存储所有核心和系统程序信息)。/var/log里的文件经常不确定地增长，应该定期清除。
4. /var/lock
锁定文件。许多程序遵循在/var/lock 中产生一个锁定文件的约定，以用来支持他们正在使用某个特定的设备或文件。其他程序注意到这个锁定文件时，就不会再使用这个设备或文件。
5. /var/run
保存在下一次系统引导前有效的关于系统的信息文件。例如， /var/run/utmp 包含当前登录的用户的信息。
6. /var/spool
放置“假脱机( spool )”程序的目录，如mail、news、打印队列和其他队列工作的目录。每个不同的spool在/var/spool 下有自己的子目录，例如，用户的邮箱就存放在/var/spool/mail中。
7. /var/tmp
比/tmp 允许更大的或需要存在较长时间的临时文件。注意系统管理员可能不允许/var/tmp 有很旧的文件。
